据台湾“今日新闻”报道，马英九上任传出也逃不过台湾安全单位的监控。报道引述台湾某杂志的内容称，台当局“国安局”在马英九还没就职前，试图透过“刑事局”监控马英九家中的计算机，同时间，民进党主席蔡英文也可能在监控名单里。由于两个对象的名字都有“英”，所以“国安局”就把这个计划取名“双鹰计划”。

台湾《时报周刊》报道，今年四月初台“国安局”给了一份计算机监控名单，其中一个IP地址是马英九位于木栅的住家地址。台“刑事局”一看非同小可，赶快进一步确认，才发现名单中除了马英九，还有民进党主席蔡英文。

该刊说，台“国安局”因为怕被抓到把柄，所以刻意不自行声请“国安”监听票，改请“刑事局”用侦查监听的方式进行监控。虽然那时候马英九还没有接任领导人，但“国安局”这项动作“太过”，难怪马英九在就职演说中，特别强调台湾“将不会再有非法监听”。

当时外界分析，或许马英九也得知被监控的讯息，所以刻意做出这样的宣示；而台湾情治高层也赶紧灭火，一方面终止这个行动，一方面当时还掌管“国安局”的许惠佑也对外否认是幕后操作的人物，并强调外界的传闻大多不实。