台检方就“国务机要费”流向3日侦讯陈水扁4小时后，陈水扁随即举行记者会展开大反击，把李登辉及马英九拉下水，狡辩自己并无不法。另外，据台湾《苹果日报》4日消息，他随后又否认调查局前局长叶盛茂的说辞，声称并没有“收到公文”，也没有说过公文“找不到了”。

牵扯到李登辉马英九

陈水扁可能担心国务机要费案被起诉，几乎把3日当成法院审判前终结辩论庭，多次慷慨陈述他推动机密“外交”工作；还以李登辉使用国务机要费及马英九特别费案为例，强调并无不法。

但办案人员检视15项机密“外交”文件，发现内容只简单提到和特定外国人士活动，部分虽有签名领款人名字，但并不是“总统府”正式公文书，陈水扁无法提出这些活动是公款支用证明。检方判断陈水扁可能藉此拖延侦办进度。

陈水扁在记者会半小时都站着说话，完全看不出身体有任何不适，反而像电视台名嘴。他首先阐述“国务机要费”是“台湾最早也是最特别的特别费”后，还不时秀出看板让记者看清楚，将矛头指向李登辉任内每年凭领据列报的“国务机要费”都超过50%，他还说：“(李登辉)奉天项目也是政府的钱，公家的钱”，但“为了对日工作，也可以交给某个‘总统’信任的民间人士，甚至绝大多数75%是没有单据的。”

陈水扁随后把“炮口”转向“马英九特别费怎么用”，又拿出数据板辅助说，马担任台北市长时特别费案，判决也可当参考。他怀疑马将特别费汇了50万美元给在美国的女儿，反观他“国务机要费”没放到自己口袋，也没汇到海外，暗讽司法单位对马、扁是两套标准。

陈水扁：没看到什么公文

媒体当场询问陈水扁家海外资金状况，陈水扁答：“有关海外资金部分，我真的不了解。”至于叶盛茂公文隐匿风暴，他说：“今天特侦组也问到这个问题，我也作了非常详尽说明，在我从特侦组回到办公室后也接获台北地检署证人传票，要我为这个案子作证，既然还在调查当中我必须尽我义务与责任说明。”

陈水扁强调，“‘总统’有来自各方面情资报告一大堆，真真假假无从判断，所以有关第一次口头报告，叶盛茂也说不够具体，所以我问了我太太，她也说绝对没有这回事，我只有选择相信太太，至于今年的二度报告，那是情资报告，我们只是看到一些情资报告，我们并没有看到什么公文”，“不过，（叶盛茂）报告之前，我已经再三追问我太太，也得到她首度的承认，在海外汇流资金，所以当叶盛茂报告时我已经知道了，就是这样！”